崇神天皇の即位と疫病

御間城入彦五十瓊殖天皇（崇神天皇）は、稚日本根子彦大日日天皇（開化天皇）の第二子である。母は伊香色謎命といい、物部氏の遠い祖先の大綜麻杵の娘である。天皇は十九歳で皇太子となられた。生まれつき聡明で、幼いころから雄々しいことを好まれ、成人してからは心が広く慎み深く、天つ神・国つ神をあつく敬われた。常に天下を治める大業を成し遂げようというお心をお持ちであった。六十年夏四月、稚日本根子彦大日日天皇が崩御された。

元年春正月十三日、皇太子は天皇の位につかれた。皇后を尊んで皇太后とした。二月十六日、御間城姫を皇后とされた。これより前に、皇后は活目入彦五十狭茅天皇（垂仁天皇）、彦五十狭茅命、国方姫命、千千衝倭姫命、倭彦命、五十日鶴彦命をお生みになっていた。また妃の、紀伊国の荒河戸畔の娘の遠津年魚眼眼妙媛は、豊城入彦命と豊鍬入姫命を生んだ。次の妃の尾張大海媛〔一説には大海宿禰の娘の八坂振天某辺という〕は、八坂入彦命、渟名城入姫命、十市瓊入姫命を生んだ。この年は甲申の年である。三年秋九月、都を磯城に移された。これを瑞籬宮という。

四年冬十月二十三日、天皇は詔して言われた。「わが皇祖をはじめ歴代の天皇が皇位につかれたのは、どうしてご自身一人のためであろうか。人と神とを治め導き、天下を整えるためである。だからこそ代々はるかな功業を広め、その時々にすぐれた徳を行き渡らせてきた。いま私は天命を受けて皇位を継ぎ、民をいつくしみ養っている。どのようにして皇祖の跡をたどり、窮まりない皇位を永く保てばよいだろうか。群臣・百官よ、おまえたちの忠誠を尽くし、ともに天下を安らかにしようではないか。」

五年、国中に疫病が多く、民の死ぬ者は半数を超えようとした。六年、百姓は故郷を離れてさまよい、背く者も出た。その勢いは徳によって治めることが難しかった。そこで天皇は朝早く起き、夜まで恐れ慎んで、天つ神・国つ神に罪を請うた。これより前、天照大神と倭大国魂の二神を、ともに天皇の御殿の中に祭っていた。しかしその神の威勢を畏れ、ともに住むのは安らかでなかった。そこで天照大神を豊鍬入姫命に託して、倭の笠縫邑に祭り、堅固な石の神籬（ひもろぎ）を立てた〔神籬はヒモロギと読む〕。また日本大国魂神を渟名城入姫命に託して祭らせた。ところが渟名城入姫命は髪が抜け、体がやせ衰えて、祭ることができなかった。

巻第五は崇神天皇一代の紀です。「欠史八代」と違い、詔・疫病・神祭り・四道将軍・反乱鎮圧・課役の制定など、具体的な出来事が次々に語られます。崇神天皇は「御肇国天皇（はつくにしらすすめらみこと）」と称され、実在の可能性が高い最初の天皇ともいわれます。都の瑞籬宮は、三輪山のふもと（奈良県桜井市金屋付近）に伝承地があります。

この章では、宮中に祭られていた天照大神を外に出して笠縫邑に祭る話が語られます。笠縫邑は奈良県桜井市の檜原神社付近とする説が有力で、「元伊勢」と呼ばれます。のちの垂仁天皇紀で、天照大神は倭姫命に託されて伊勢に遷ることになり、伊勢神宮の起源譚へとつながっていきます。